Protein–RNA interactions for Protein: Q64705

Usf2, Upstream stimulatory factor 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 346 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf2Q64705 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Plscr3-201ENSMUST00000019605 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Sema5b-202ENSMUST00000120756 4646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Aatk-201ENSMUST00000064307 5336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cit-203ENSMUST00000112008 6087 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Usf2Q64705 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms