Protein–RNA interactions for Protein: Q64448

Gja3, Gap junction alpha-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja3Q64448 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pfdn6-205ENSMUST00000174426 396 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 AC153937.4-201ENSMUST00000218479 661 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cd209g-201ENSMUST00000130372 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 9130410C08Rik-201ENSMUST00000155499 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 AC166349.1-201ENSMUST00000220866 695 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gja3Q64448 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms