Protein–RNA interactions for Protein: Q64213

Sf1, Splicing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 653 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf1Q64213 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Sf1Q64213 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sf1Q64213 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sf1Q64213 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sf1Q64213 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sf1Q64213 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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Sf1Q64213 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sf1Q64213 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms