Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Trim24Q64127 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Trim24Q64127 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim24Q64127 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms