Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Pacs2-201ENSMUST00000084891 5480 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
Pan3Q640Q5 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.07□□□□□ -0.16
Pan3Q640Q5 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.07□□□□□ -0.16
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Pan3Q640Q5 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
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