Protein–RNA interactions for Protein: Q640N4

Zfp248, Zinc finger protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp248Q640N4 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Il6ra-202ENSMUST00000197679 8639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Zfp248Q640N4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms