Protein–RNA interactions for Protein: Q640L5

Ccdc18, Coiled-coil domain-containing protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 1,455 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc18Q640L5 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Coq7-205ENSMUST00000209146 799 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Lpar5-201ENSMUST00000088292 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm16000-201ENSMUST00000146657 447 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm18624-201ENSMUST00000220966 658 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm9899-201ENSMUST00000065519 555 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tnnt1-208ENSMUST00000166161 750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tmco5b-201ENSMUST00000040856 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gprc5c-208ENSMUST00000177952 1809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc18Q640L5 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Tbc1d17-209ENSMUST00000207293 692 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Sec11a-202ENSMUST00000117383 1094 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc18Q640L5 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
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