Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CochQ62507 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ifnz-201ENSMUST00000105144 1462 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
CochQ62507 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
CochQ62507 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
CochQ62507 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms