Protein–RNA interactions for Protein: Q62470

Itga3, Integrin alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga3Q62470 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fastk-203ENSMUST00000115043 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Itga3Q62470 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms