Protein–RNA interactions for Protein: Q62447

Ccnc, Cyclin-C, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CcncQ62447 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.06
CcncQ62447 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CcncQ62447 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms