Protein–RNA interactions for Protein: Q62445

Sp4, Transcription factor Sp4, mousemouse

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp4Q62445 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm7063-201ENSMUST00000186840 981 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 CT025555.1-201ENSMUST00000225901 1217 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Sp4Q62445 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms