Protein–RNA interactions for Protein: Q62240

Kdm5d, Lysine-specific demethylase 5D, mousemouse

Predictions only

Length 1,548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5dQ62240 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Zdhhc4-208ENSMUST00000161915 1216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm33045-202ENSMUST00000210049 975 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 AC139580.1-202ENSMUST00000223574 928 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
Kdm5dQ62240 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Zfp414-204ENSMUST00000166627 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm12057-202ENSMUST00000189990 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Zfp414-201ENSMUST00000073570 1197 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm27839-201ENSMUST00000184242 106 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm45799-201ENSMUST00000106785 367 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Lamtor2-201ENSMUST00000029698 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Kdm5dQ62240 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms