Protein–RNA interactions for Protein: Q62192

Cd180, CD180 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd180Q62192 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cd180Q62192 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Dlx4os-201ENSMUST00000156477 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cd180Q62192 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.8 ms