Protein–RNA interactions for Protein: Q62189

Snrpa, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnrpaQ62189 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ushbp1-201ENSMUST00000049184 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
SnrpaQ62189 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SnrpaQ62189 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.8 ms