Protein–RNA interactions for Protein: Q62187

Ttf1, Transcription termination factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf1Q62187 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.4□□□□□ -0.1
Ttf1Q62187 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Ttf1Q62187 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms