Protein–RNA interactions for Protein: Q62178

Sema4a, Semaphorin-4A, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema4aQ62178 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Sema4aQ62178 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Sema4aQ62178 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms