Protein–RNA interactions for Protein: Q62167

Ddx3x, ATP-dependent RNA helicase DDX3X, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx3xQ62167 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Trp53i11-201ENSMUST00000090554 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Ttc24-201ENSMUST00000050258 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Ddx3xQ62167 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ddx3xQ62167 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms