Protein–RNA interactions for Protein: Q62018

Ctr9, RNA polymerase-associated protein CTR9 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctr9Q62018 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ctr9Q62018 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Serpinf1-201ENSMUST00000000769 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctr9Q62018 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms