Protein–RNA interactions for Protein: Q61313

Tfap2b, Transcription factor AP-2-beta, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfap2bQ61313 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nde1-201ENSMUST00000023359 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Tfap2bQ61313 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Tfap2bQ61313 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms