Protein–RNA interactions for Protein: Q61069

Usf1, Upstream stimulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf1Q61069 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 B9d1-201ENSMUST00000102657 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Usf1Q61069 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Abhd11-202ENSMUST00000111216 972 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm14127-201ENSMUST00000117906 678 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Usf1Q61069 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.6 ms