Protein–RNA interactions for Protein: Q61068

Usp17la, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein A, mousemouse

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Length 526 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17laQ61068 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp17laQ61068 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp17laQ61068 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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Usp17laQ61068 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp17laQ61068 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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Usp17laQ61068 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Usp17laQ61068 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
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Usp17laQ61068 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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Usp17laQ61068 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gm33785-201ENSMUST00000222961 886 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Usp17laQ61068 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
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