Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dlg1-201ENSMUST00000023454 3725 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
JrkQ60976 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms