Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Rbbp4Q60972 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.2 ms