Protein–RNA interactions for Protein: Q60867

Neurod1, Neurogenic differentiation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Neurod1Q60867 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 BC037032-201ENSMUST00000140003 3974 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Kctd14-205ENSMUST00000206279 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Neurod1Q60867 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms