Protein–RNA interactions for Protein: Q60764

Mkrn3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-3, mousemouse

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn3Q60764 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm12702-201ENSMUST00000123258 612 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC124408.1-201ENSMUST00000228938 707 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Pgap2-204ENSMUST00000120879 2141 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gpt2-201ENSMUST00000034136 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 Gm45359-201ENSMUST00000210635 427 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Mkrn3Q60764 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms