Protein–RNA interactions for Protein: Q60673

Ptprn, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase-like N, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprnQ60673 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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PtprnQ60673 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PtprnQ60673 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
PtprnQ60673 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
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PtprnQ60673 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms