Protein–RNA interactions for Protein: Q5VCS6

Tdrd5, Tudor domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd5Q5VCS6 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Slc33a1-203ENSMUST00000161659 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Tdrd5Q5VCS6 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tdrd5Q5VCS6 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms