Protein–RNA interactions for Protein: Q5SZ99

Trim38, Tripartite motif-containing 38, mousemouse

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Length 471 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trim38Q5SZ99 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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Trim38Q5SZ99 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Trim38Q5SZ99 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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Trim38Q5SZ99 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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