Protein–RNA interactions for Protein: Q5SWD9

Tsr1, Pre-rRNA-processing protein TSR1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsr1Q5SWD9 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Vmn1r-ps10-201ENSMUST00000176165 889 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tarsl2-201ENSMUST00000032728 3192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Gm6991-201ENSMUST00000218475 1178 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Tsr1Q5SWD9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43 ms