Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSL4

Abr, Active breakpoint cluster region-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AbrQ5SSL4 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
AbrQ5SSL4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
AbrQ5SSL4 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.7 ms