Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJI4

Pkdcc, Extracellular tyrosine-protein kinase PKDCC, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PkdccQ5RJI4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PkdccQ5RJI4 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cks1b-201ENSMUST00000029679 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 AI413582-204ENSMUST00000154473 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PkdccQ5RJI4 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms