Protein–RNA interactions for Protein: Q5QNQ9

Col27a1, Collagen alpha-1(XXVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col27a1Q5QNQ9 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm42906-201ENSMUST00000202365 408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc90b-201ENSMUST00000032842 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 AC158987.1-201ENSMUST00000214586 961 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Prss41-201ENSMUST00000024926 1128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 AC114008.2-201ENSMUST00000227699 1347 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ccdc33-202ENSMUST00000098681 1093 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rgs6-204ENSMUST00000185674 1362 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pop7-202ENSMUST00000111035 988 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Mrps17-201ENSMUST00000042191 832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm8399-201ENSMUST00000082300 1117 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Plpp4-201ENSMUST00000094018 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Alkbh3-201ENSMUST00000040005 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Col27a1Q5QNQ9 Dixdc1-202ENSMUST00000117093 1613 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms