Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND29

Rilp, Rab-interacting lysosomal protein, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RilpQ5ND29 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fbxo21-201ENSMUST00000035579 3883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm996-201ENSMUST00000114217 4881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Nomo1-201ENSMUST00000033121 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ppfia3-201ENSMUST00000003961 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
RilpQ5ND29 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms