Protein–RNA interactions for Protein: Q5ND28

Scarf1, Scavenger receptor class F member 1, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scarf1Q5ND28 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tnfsf13-202ENSMUST00000108648 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm20708-201ENSMUST00000132298 1780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Scarf1Q5ND28 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms