Protein–RNA interactions for Protein: Q5FWC9

Gm3558, Predicted gene 3558, mousemouse

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Length 205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3558Q5FWC9 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pard3-202ENSMUST00000079777 3394 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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Gm3558Q5FWC9 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
Gm3558Q5FWC9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms