Protein–RNA interactions for Protein: Q571J5

Znf354c, Zinc finger protein 354C, mousemouse

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf354cQ571J5 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Sox2ot-202ENSMUST00000196058 753 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Acot10-201ENSMUST00000052910 1537 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Znf354cQ571J5 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.2 ms