Protein–RNA interactions for Protein: Q56A10

Znf608, Zinc finger protein 608, mousemouse

Predictions only

Length 1,511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf608Q56A10 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Hist1h2aa-201ENSMUST00000072391 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Platr12-202ENSMUST00000189722 549 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ighv8-8-201ENSMUST00000192591 358 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm13226-201ENSMUST00000117838 404 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm7067-201ENSMUST00000207698 1249 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ninj1-202ENSMUST00000120733 1321 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Camp-201ENSMUST00000112022 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Slc2a9-207ENSMUST00000143758 1296 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 AC154687.2-201ENSMUST00000223853 640 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Fam219aos-201ENSMUST00000151164 708 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 4930473A02Rik-202ENSMUST00000136793 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Znf608Q56A10 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Ift20-203ENSMUST00000128788 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Vhl-ps1-201ENSMUST00000174813 597 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 B3galt4-201ENSMUST00000087543 1569 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Tssc4-202ENSMUST00000105920 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Znf608Q56A10 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms