Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Lrig2Q52KR2 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 8030474K03Rik-202ENSMUST00000151231 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lrig2Q52KR2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms