Protein–RNA interactions for Protein: Q4U4S6

Xirp2, Xin actin-binding repeat-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 3,784 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp2Q4U4S6 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.42□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Blvra-201ENSMUST00000002064 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm29202-201ENSMUST00000191263 422 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hspb8-201ENSMUST00000036991 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Crym-201ENSMUST00000033198 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.41□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.4□□□□□ -0.58
Xirp2Q4U4S6 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lce1j-202ENSMUST00000186525 703 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.4□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm10044-201ENSMUST00000081331 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Xirp2Q4U4S6 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.39□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms