Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Fam220aQ3ZN08 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Islr2-201ENSMUST00000114144 3880 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 BC003965-201ENSMUST00000088307 3022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Fam220aQ3ZN08 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Lgals8-202ENSMUST00000099821 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mypopos-202ENSMUST00000205975 2321 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Fam220aQ3ZN08 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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