Protein–RNA interactions for Protein: Q3V3Q7

Pacs2, Phosphofurin acidic cluster sorting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacs2Q3V3Q7 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm45251-201ENSMUST00000209486 1465 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm39317-201ENSMUST00000213360 1138 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pacs2Q3V3Q7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm12106-201ENSMUST00000116006 1200 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm20865-201ENSMUST00000179095 856 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Pacs2Q3V3Q7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms