Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

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Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp48Q3V0C5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Mir6977-201ENSMUST00000184960 64 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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Usp48Q3V0C5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Usp48Q3V0C5 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
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