Protein–RNA interactions for Protein: Q3V036

Ccdc27, Coiled-coil domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc27Q3V036 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Ccdc27Q3V036 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Atp11b-201ENSMUST00000029257 4868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Ccdc27Q3V036 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.8 ms