Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rnpc3Q3UZ01 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm15358-201ENSMUST00000119249 520 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Rnpc3Q3UZ01 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms