Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Cnga3-203ENSMUST00000194195 2083 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fbxo10-201ENSMUST00000052236 4635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gng4-201ENSMUST00000021734 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ncmap-204ENSMUST00000105859 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-204ENSMUST00000087877 3947 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fmn2-201ENSMUST00000030039 6442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Rcan1-201ENSMUST00000023672 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Zfp467-205ENSMUST00000114560 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ubxn4-201ENSMUST00000027592 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Zfp109-201ENSMUST00000037448 1935 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Syngap1-201ENSMUST00000081285 4315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Psma3-202ENSMUST00000160027 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Ints14-201ENSMUST00000037504 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Lipe-202ENSMUST00000054301 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Ccdc160Q3UYG1 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.5 ms