Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trim75Q3UWZ0 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Acss1-201ENSMUST00000028944 3618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trim75Q3UWZ0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms