Protein–RNA interactions for Protein: Q3UV55

Nr1d1, Nuclear receptor subfamily 1 group D member 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nr1d1Q3UV55 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hmga2-201ENSMUST00000072777 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Brpf1-209ENSMUST00000204198 4307 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Syde2-204ENSMUST00000212479 3810 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nr1d1Q3UV55 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.9 ms