Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Gm28047Q3US59 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms