Protein–RNA interactions for Protein: Q3URI6

Zfp560, Zinc finger protein 560, mousemouse

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp560Q3URI6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 H13-203ENSMUST00000109825 1063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zfp560Q3URI6 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms