Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
D13Ertd608eQ3UPR8 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
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D13Ertd608eQ3UPR8 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
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